La LH, comme les autres hormones de l'hypophyse antérieure est une glycoprotéine formée par l'assemblage de deux chaînes d'acides aminés dénommées α ou a2 et β. Ce fichier de la Proteine Data Bank (1m92) ne contient que la chaîne β (il s'agit d'une structure théorique non controlée par cristallographie).



Entrez les commandes ci-dessus et pressez la touche "Entrée", ou cliquez sur le bouton "Execute" (vous pouvez placer plusieurs commandes à la suite, si vous les séparez par des points-virgules). Alternativement, vous pouvez utiliser la console de l'applet (la console se déplace dans cette fenêtre en la saisissant par sa barre supérieure).

Aide sur le langage de commande.

Commandes N'hésitez pas à faire tourner la molécule en cliquant et en glissant le curseur souris, à zoomer en appuyant sur majuscule et glissant le cuseur souris de bas en haut.

En cliquant (dans l'ordre !) sur les liens de la colonne de droite vous exécuterez les commandes affichées dans la colonne de gauche.
show sequence La séquence s'affiche dans la fenêtre de commande de Rasmol (pour voir le résultat de cette commande dans Jmol, il faut d'abord ouvrir la console :
MET GLU MET LEU GLN GLY LEU LEU LEU LEU LEU LEU LEU SER MET GLY GLY ALA TRP ALA SER ARG GLU PRO LEU ARG PRO TRP CYS HIS PRO ILE ASN ALA ILE LEU ALA VAL GLU LYS GLU GLY CYS PRO VAL CYS ILE THR VAL ASN THR THR ILE CYS ALA GLY TYR CYS PRO THR MET MET ARG VAL LEU GLN ALA VAL LEU PRO PRO LEU PRO GLN VAL VAL CYS THR TYR ARG ASP VAL ARG PHE GLU SER ILE ARG LEU PRO GLY CYS PRO ARG GLY VAL ASP PRO VAL VAL SER PHE PRO VAL ALA LEU SER CYS ARG CYS GLY PRO CYS ARG ARG SER THR SER ASP CYS GLY GLY PRO LYS ASP HIS PRO LEU THR CYS ASP HIS PRO GLN LEU SER GLY LEU LEU PHE LEU
Cette séquence représente la structure primaire
wireframe off
cartoon on
color structure 		La structure secondaire de la molécule apparaît
cartoon off
color white
dots on 		L'espace occupé par la molécule et sa forme globale constitue la structure tertiaire.
dots off
backbone 0.3
color chain 		On réaffiche le squelette de la chaîne. La molécule présente des replis, comment sont-ils maintenus ?.
select cys
color cpk
wireframe on
spacefill 0.8 		Les atomes des acides aminés cystéine sont visualisés en "mode sphère" rapport au reste de la molécule (sauf les hydrogènes non représentés); chaque cysténine a pour particularité de posséder un atome de soufre (ici coloré en jaune). Comment sont-ils disposés ?
set ssbonds sidechain
ssbond 0.6
 ou
ssbond off 		Afficher ou masquer les liaisons faibles entre atomes de soufre (qui lient les boucles de la chaîne).
select all
spacefill off
wireframe 0.2
color cpk 		Réinitialiser l'affichage.

Références

Les gonadotropines FSH, LH et choriogonadotropine CG www2.cndp.fr
La page n'est plus fonctionnelle mais présente des informations sur la structure de cette famille de molécules
Adresse de cette page: http://www.didac-tic.fr/pdb/lh/index.php